Прошло два года с момента вторжения Тендосюу на Центральный терминал О-Эдо. С тех пор Йорозуя разошлись. Предвидя возвращение Уцуро, Гинтоки Саката начинает исследовать земные линии силы, чтобы найти следы его Алтанны.
Гинтоки, Шинпачи и Кагура возвращаются в роли веселых, но разоренных членов команды “Йорозуя”! Живя в альтернативной реальности Эдо, где мечи запрещены, а инопланетные захватчики завоевали Японию, они пытаются выжить, занимаясь любой работой.
Пока Гинтоки Саката был в отъезде, в “Ёродзуе” появился новый лидер: Кинтоки, его золотистый двойник. Чтобы вернуть свою прежнюю должность, Гинтоки понадобится помощь окружающих, что проблематично, поскольку никто его не помнит!
Сбежав из штаб-квартиры Йорузуи в замешательстве, Шинпачи обнаруживает, что все жители Эдо претерпели невероятно сильные изменения как во внешности, так и в характере. Самое невероятное - его сестра Отаэ вышла замуж за главу Синсэнгуми.
После того, как Гинтоки и его команда присоединились к сопротивлению против бакуфу, они скрываются вместе с Кацурой и его повстанцами Дзёи. К Йорозуе вскоре обращаются Нобуме Имаи и два члена Кихейтаи.
Эдо – город, который когда-то был домом для храбрости и амбиций самураев со всей страны. Однако после того, как феодальная Япония сдалась могущественным пришельцам, известным как “Аманто”, эти стремления теперь кажутся недостижимыми.
Когда Гинтоки арестовывает кино-пирата на премьере, он проверяет запись с камеры и обнаруживает, что его переносит в мрачный постапокалиптический Эдо, где загадочная эпидемия, известная как “Белая Чума”, опустошила население мира.
После временного отступления Армии Освобождения Алтанны из района Кабуки, ситуация на войне, казалось бы, улучшилась. Однако, пока Онивабан, Синсэнгуми и жители района сражаются с остатками армии, величайший изобретатель Эдо, Гэнгэи Хирага, похищен.
Уцуро, бессмертный лидер Нараку, провоцирует межпланетный конфликт, заманивая Армию Освобождения Алтаны в смертельную ловушку. Гинтоки, Кагура и Синпачи должны объединиться, чтобы противостоять двум угрозам и спасти Землю от уничтожения.
Yorozuya сражаются с тайной организацией, которая хочет захватить мощный меч Бенидзакура, и Гинтоки должен сделать невозможное, чтобы спасти Кацуру и восстановить мир в Эдо.
Yorozuya возвращаются к своим обычным приключениям в комедийном Gintama.: Porori-hen, где Гинтоки и Кагура справляются с новыми испытаниями, и Умибозу сталкивается с непростым выбором в отношении своей дочери.
Сайтама, герой, который может победить любого врага одним ударом, вступает в Ассоциацию Героев, чтобы найти новые вызовы и пережить волнение от сражений.
Гинтоки возвращается в Эдо и встречает Шинпачи, но их встреча прерывается дракой. Тем временем Кондо пытается жениться на принцессе Аманто, но неожиданно встречает препятствия.
Хидзиката становится отаку из-за проклятого меча, а Ито пытается свергнуть его. Пирако, новая знакомая Ёродзуи, вызывает гражданскую войну в районе Кабуки.
Казума и его команда отправляются в деревню Алых Демонов, чтобы проведать Мегумин. Они узнают, что “серьезная” угроза, о которой сообщалось, была просто шуткой. Однако, по мере изучения деревни, команда начинает подозревать, что угроза могла быть реальной.
Ёсивара, район красных фонарей, захвачен наркотиком любви. Цукуё, капитан Хякка, влюбляется в Гинтоки из-за наркотика, но ее чувства были и раньше. Вместе с Ёрозуей она должна преодолеть влияние наркотика и вернуть всех в нормальное состояние.
Казума и его необычный отряд авантюристов продолжают свои приключения, накапливая долги и попадая в нелепые ситуации. Они получают приглашение от принцессы, что обещает еще больше бед и смеха.
В эпизоде про Бена Джонсона Ёродзуя отмечают Новый год у котацу, поедая мандарины. Шинпачи жалуется на лень аниматоров, а Гинтоки завершает сцену абсурдным заявлением.
Продолжение истории о Кадзуме и его команде неудачливых авантюристов в фэнтезийном мире, полное юмора и абсурдных ситуаций. Они пытаются заработать деньги, сражаться с монстрами и терпеть друг друга.
Переродившись в фэнтезийном мире, Казума вынужден бороться с Королём Демонов, но его сопровождает бесполезная богиня Аква, и им приходится зарабатывать на жизнь, вместо героических приключений.