Действие фильма берет начало спустя год после событий аниме-сериала. Акихито предстоит встретиться лицом к лицу с новой угрозой, которая намеревается добраться до Мирай, и защитить своих близких друзей.
В этой истории рассказывается о юноше Такаши Нацумэ, унаследовавшего от бабушки Рэйко Нацумэ способность видеть духов. От чего, впрочем, он совсем не в восторге — ведь всю жизнь духи доставляли ему одни неприятности.
Такаши Нацумэ всё так же видит духов и как раньше вместе со своим телохранителем Мадарой старается освободить их, возвращая имена и тем самым освобождая от сил «Тетради дружбы».