Год 22XX. Прошло 100 лет со времен войны человечества и реплоидов. Человечество победило и реплоиды подверглись массовому уничтожению. И только повстанцы под предводительством Сиэль продолжают держаться. У них только одна надежда на спасение - реплоид, участвовавший в той войне, Рокмэн Зеро.
Студент университета Каджиура Таро и красавица-выпускница Ёруто Хару в составе этнографической экспедиции отправляются на отдаленный изолированный остров Икишима собирать местные обычаи, сказки, легенды.