Манга «Спокойной ночи, Пунпун» с виду похожа на обычную школьную историю об обычных школьниках. Но только с виду. Уже с первых страниц в глаза бросается карикатурное изображение главного героя — маленькая птичка. И это только начало, далее на сцену выходят ещё более потрясающие своей нелепостью персонажи.
Кондо Масахико янки-старшеклассник с выдающимися физическими способностями, в то время как его старший брат Йоширо это спокойный и нежный воспитатель детского сада, так что это не редкость, что младший брат защищает старшего.