Через год после битвы в «Granite Inn», из которой неожиданно Дести Нова выходит победителем, восстанавливает мозг и тело Галли, используя сделанные ими открытия в области нанотехнологий.
Алита - мощный киборг с мягким сердцем и таинственным прошлым. Её новая жизнь непроста - её сердце разбито, она приобретает и теряет друзей в Свалке - жестоком мире, лежащем ниже небесного города и служит многим хозяевам чтобы защищать невинный и построить свою новую жизнь.