Прямое продолжение первого сезона. Зеро возвращается после его исчезновения из Академии. Несмотря на испытываемое ею облегчение, Юки (чьё прошлое по-прежнему покрыто тайной), гадает, что же именно случилось с Зеро после того, как они разлучились. Зеро, сохранив странные видения, появившееся в тот день, когда он испил крови Канаме, посещает пробудившуюся Марию Куренай в поисках ответов на свои вопросы. Она не даёт ему ничего, кроме загадочной подсказки, содержащей предположение о том, кто может быть настоящим врагом.
Тем временем вампиры из Высшего Совета Вампиров прибывают в академию с целью покарать Зеро за совершённый им грех — убийство чистокровного. Однако Канаме вмешивается в решение совета — не только с целью спасти Зеро, но и по иной причине, о которой не догадывается никто из его окружения.
Академия Кросс — элитная школа с двумя раздельными классами, изолированными друг от друга: Дневным и Ночным. Префектам академии вменяется в обязанность поддерживать порядок между учащимися, когда вечером классы сменяют друг друга.
Главный герой не размахивает мечом, не выкрикивает боевой клич и вообще не отличается ничем, особенно героическим. Всё в этом молодом человеке по имени Сайтама так и вопит: «заурядный» — и его лысая голова, и его хилое телосложение.
14-летняя Итиго Амано ужасно неуклюжая девушка и не умеет ничего, кроме изготовления выпечки. Однажды на фестивале сладостей она знакомится с профессиональным кондитером Анри Лукой.